O se Auupega Fou mo le Su'esu'eina o le Tuberculosis ma le Iloa o le Tete'e atu i Fuala'au Fa'asaina: O se Fa'asologa Fa'atatau o le Tupulaga Fou (tNGS) Fa'atasi ma le A'oa'oina o Masini mo le Su'esu'eina o le Tuberculosis Hypersensitivity
Lipoti tusitusia: CCa: o se faʻataʻitaʻiga faʻamaʻi e faʻavae i luga o le tNGS ma le masini aʻoaʻoina, lea e talafeagai mo tagata e itiiti le siama o le TB ma le meningitis TB.
Igoa o le mataupu: Fa'asologa o le tupulaga fou e fa'atatau i le TB ma le a'oa'oina o masini: o se fuafuaga fa'apitoa mo su'esu'ega o tubula mama ma le meningitis tubula.
Vaitaimi: 《Clinica Chimica Acta》
AFAI: 6.5
Aso na lolomiina ai: Ianuari 2024
I le tuufaatasia ai ma le Iunivesite o le Aoga o Saienisi a Saina ma le Falemai o le Falemai o le Iunivesite o Capital, na faatuina ai e le Macro & Micro-Test se faataitaiga o le suʻesuʻeina o le mamapala e faavae i luga o le tupulaga fou o le tekinolosi faʻatulagaina faʻatulagaina (tNGS) ma le metotia o le aʻoaʻoina o masini, lea na maua ai le maaleale tele o le iloa mo le mamapala e itiiti ni siama ma le maʻi pipisi o le mamapala, ma maua ai se metotia fou o le suʻesuʻeina o le maaleale mo le suʻesuʻeina o ituaiga e lua o le mamapala, ma fesoasoani i le saʻo o le suʻesuʻega, le iloa o le teteʻe atu i vailaʻau ma le togafitia o le mamapala. I le taimi lava e tasi, ua iloa ai e mafai ona faʻaaogaina le cfDNA plasma a le maʻi o se ituaiga faʻataʻitaʻiga talafeagai mo le suʻesuʻeina o le mamapala i le suʻesuʻeina o le TBM.
I lenei suʻesuʻega, e 227 faʻataʻitaʻiga o le plasma ma faʻataʻitaʻiga o le vai o le cerebrospinal na faʻaaogaina e faʻatuina ai ni vaega faʻapitoa se lua, lea na faʻaaogaina ai faʻataʻitaʻiga o le vaega suʻesuʻe i le fale suʻesuʻe e faʻatuina ai le faʻataʻitaʻiga o le masini aʻoaʻoina o le faʻamaʻi o le tuberculosis, ma faʻaaogaina faʻataʻitaʻiga o le vaega suʻesuʻe faʻapitoa e faʻamaonia ai le faʻataʻitaʻiga faʻamaʻi ua faʻatuina. O faʻataʻitaʻiga uma na muamua faʻatatauina e se vaitaele suʻesuʻe puʻeina faʻapitoa na mamanuina mo le Mycobacterium tuberculosis. Ona, e faʻavae i luga o faʻamaumauga o le TB-tNGS, e faʻaaogaina le faʻataʻitaʻiga o le laʻau faʻaiʻuga e faʻatino ai le faʻamaoniga faʻa-5 i luga o seti aʻoaʻoga ma faʻamaoniga o le faʻasologa o suʻesuʻega i le fale suʻesuʻe, ma maua ai tapulaʻa suʻesuʻega o faʻataʻitaʻiga plasma ma faʻataʻitaʻiga o vai o le cerebrospinal. O le tapulaʻa na maua e aumaia i totonu o seti suʻega se lua o le faʻasologa o suʻesuʻega faʻapitoa mo le iloa, ma o le faʻatinoga o suʻesuʻega a le tagata aʻoaʻo e iloiloina e le ROC curve. Mulimuli ane, na maua ai le faʻataʻitaʻiga o le suʻesuʻega o le tuberculosis.
Ata 1 o le ata fa'ata'ita'i o le mamanu o su'esu'ega
Fa'ai'uga: E tusa ai ma tulaga fa'apitoa o le fa'ata'ita'iga o le CSF DNA (AUC = 0.974) ma le fa'ata'ita'iga o le plasma cfDNA (AUC = 0.908) na fuafuaina i lenei su'esu'ega, i totonu o fa'ata'ita'iga e 227, o le ma'ale'ale o le fa'ata'ita'iga o le CSF e 97.01%, o le fa'apitoa e 95.65%, ma o le ma'ale'ale ma le fa'apitoa o le fa'ata'ita'iga o le plasma e 82.61% ma le 86.36%. I le su'esu'ega o fa'ata'ita'iga e 44 o le plasma cfDNA ma le cerebrospinal fluid DNA mai gasegase TBM, o le fuafuaga fa'amaonia o lenei su'esu'ega e maualuga le tutusa o le 90.91% (40/44) i le plasma cfDNA ma le cerebrospinal fluid DNA, ma o le ma'ale'ale e 95.45% (42/44). I tamaiti e maua i le pulmonary tuberculosis, o le fuafuaga fa'amaonia o lenei su'esu'ega e sili atu ona ma'ale'ale i fa'ata'ita'iga o le plasma nai lo taunu'uga o le iloa e Xpert o fa'ata'ita'iga o le sua o le gastric mai gasegase lava e tasi (28.57% VS 15.38%).
Ata 2 Fa'atinoga o le su'esu'ega o le fa'ata'ita'iga o le fa'ama'i pipisi mo fa'ata'ita'iga o tagata
Ata 3 I'uga o su'esu'ega o fa'ata'ita'iga fa'apa'aga
Faaiuga: O se metotia e suʻesuʻe ai le maʻaleʻale tele mo le TB ua faʻatuina i lenei suʻesuʻega, lea e mafai ona maua ai se meafaigaluega e suʻesuʻe ai le maaleale sili ona maualuga mo le iloa o gasegase e maua i le oligobacillary TB (negative culture). O le iloa o le TB e maʻaleʻale tele e faʻavae i luga o le plasma cfDNA atonu o se ituaiga faʻataʻitaʻiga talafeagai mo le iloa o le TB o loʻo galue ma le TB meningitis (e faigofie ona aoina faʻataʻitaʻiga plasma nai lo le cerebrospinal fluid mo gasegase e masalomia o le TB o le faiʻai).
Sootaga muamua: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990? e ala i le%3Dihub
Fa'atomuaga pu'upu'u o oloa e iloa ai le fa'asologa o le tuberculosis o le Macro & Micro-Test
I le iloiloina o le tulaga faigata o faʻataʻitaʻiga o gasegase mamaʻi ma manaʻoga eseese, ua tuʻuina atu e le Macro & Micro-Test se seti atoatoa o fofo NGS mo le faʻamamaina o le suavai mai faʻataʻitaʻiga o le sputum, fausiaina ma le faʻasologa o faletusi a Qualcomm, ma le auʻiliʻiliga o faʻamaumauga. O oloa e aofia ai le vave suʻesuʻeina o gasegase mamaʻi mamaʻi, le iloa o le mamaʻi e teteʻe i vailaʻau, ituaiga o le mycobacterium tuberculosis ma le NTM, suʻesuʻega o le maaleale o le mamaʻi mamaʻi e leai ni siama ma tagata mamaʻi mamaʻi, ma isi.
Pusa su'esu'ega fa'asolosolo mo le tuberculosis ma mycobacteria:
| Aitema Numera | igoa o le oloa | anotusi o le su'ega o oloa | ituaiga faʻataʻitaʻiga | faʻataʻitaʻiga talafeagai |
| HWTS-3012 | Fa'ata'ita'iga o le sui fa'asa'oloto | Fa'aaogaina i le togafitia o fa'ata'ita'iga o le sputum i le fa'asusuina, ua maua ai se numera fa'amaumauga sili ona lelei, Sutong Machinery Equipment 20230047. | sputum | |
| HWTS-NGS-P00021 | Meafaigaluega e iloa ai le aofa'i o le Qualcomm mo le TB e ma'ale'ale tele (auala e pu'eina ai le su'esu'ega) | Su'esu'ega e le fa'alavelaveina ai le ma'ale'ale (biops vai) mo le siama-leai se siama o le pulmonary tuberculosis ma nodules o le fai'ai; O fa'ata'ita'iga o tagata na masalomia ua a'afia i le tuberculosis po'o le non-tuberculosis mycobacteria na su'esu'eina e ala i le maualuga o le fa'asologa o metagenomics, ma fa'amatalaga e iloa ai pe na a'afia le tuberculosis po'o le non-tuberculosis mycobacteria ma fa'amatalaga autu o le tete'e atu i vaila'au o le mycobacterium tuberculosis. | Toto i autafa, vai fufulu o le alveolar, hydrothorax ma ascites, fa'ata'ita'iga o le puncture focus, vai o le cerebrospinal. | Tupulaga lona lua |
| HWTS-NGS-T001 | Meafaigaluega e iloa ai le tete'e atu i vaila'au ma le fa'avasegaina o Mycobacterium (metotia o le fa'asologa o le tele o fa'ateleina) | Su'ega fa'a-Mycobacterium, e aofia ai le MTBC ma le 187 NTM；O le iloa o le Mycobacterium tuberculosis e tete'e i vaila'au e aofia ai vaila'au e 13 ma nofoaga autū e 16 o lo'o iai le fesuia'iga o kene e tete'e i vaila'au. | Sputum, vai fufulu alveolar, hydrothorax ma ascites, faʻataʻitaʻiga o le puncture focus, vai o le cerebrospinal. | Fa'avae lua o le tupulaga lona lua/tolu |
Mea Taua: HWTS-NGS-T001 Meafaigaluega e iloa ai le tete'e atu i vaila'au ma le fa'avasegaina o Mycobacterium (metotia fa'ateleina tele)
Fa'atomuaga o le oloa
O le oloa e faʻavae i luga o vailaʻau autū o le laina muamua ma le laina lona lua o loʻo faʻamatalaina i taʻiala togafitiga a le WHO TB, macrolides ma aminoglycosides e masani ona faʻaaogaina i taʻiala togafitiga a le NTM, ma o nofoaga e teteʻe atu ai i vailaʻau e aofia ai le vaega uma e tasi o nofoaga e fesoʻotaʻi ma le teteʻe atu i vailaʻau i le lisi o suiga o le WHO Mycobacterium tuberculosis complex, faʻapea foʻi ma isi kene teteʻe atu i vailaʻau ma nofoaga e suia ai vailaʻau ua lipotia mai e tusa ai ma suʻesuʻega ma fuainumera o tusitusiga e maualuga togi i totonu ma fafo atu o le atunuʻu.
O le fa'ailoaina o ituaiga o le NTM e fa'avae i luga o ituaiga o le NTM o lo'o aoteleina i ta'iala a le NTM na lomia e le Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases ma le maliliega a tagata atamamai. O nei ituaiga o le NTM ua mamanuina e mafai ona fa'ateleina, fa'asologa ma fa'ailoa mai ai le silia ma le 190 ituaiga o le NTM.
E ala i le tekinolosi fa'ateleina o le multiplex PCR fa'atatau, na fa'ateleina ai genes genotyping ma genes e tete'e i vaila'au o le Mycobacterium e ala i le multiplex PCR, ma maua ai le tu'ufa'atasiga o amplicon o genes fa'atatau e iloa. E mafai ona fausia oloa fa'ateleina i totonu o faletusi fa'asologa maualuga o le tupulaga lona lua po'o le tupulaga lona tolu, ma o fa'avae fa'asologa uma o le tupulaga lona lua ma le tupulaga lona tolu e mafai ona fa'atinoina le fa'asologa loloto e maua ai fa'amatalaga fa'asologa o genes fa'atatau. I le fa'atusatusaina ma suiga ua iloa o lo'o i totonu o le fa'amaumauga fa'asinomaga ua fausia (e aofia ai le WHO Mycobacterium tuberculosis complex mutation catalog ma lona sootaga ma le tete'e i vaila'au), na fuafuaina ai suiga e feso'ota'i ma le tete'e i vaila'au po'o le vaivai o vaila'au fa'asaga i le TB. Fa'atasi ai ma le fofo togafitiga fa'ata'ita'iga sputum e tatala e ia lava o le Macro & Micro-Test, na foia ai le fa'afitauli o le maualalo o le lelei o le fa'ateleina o le nucleic acid o fa'ata'ita'iga sputum fa'aklinikal (e sefulu taimi e sili atu nai lo auala masani), ina ia mafai ona fa'aoga sa'o le iloa o le tete'e i vaila'au i fa'ata'ita'iga sputum fa'aklinikal.
Vaega e iloa ai oloa
34genes e fesoʻotaʻi ma le teteʻe atu i vailaʻau18vailaʻau e teteʻe atu ai i le TB ma6Na maua ni vailaʻau NTM, e aofia ai297nofoaga e tete'e atu ai i vaila'au; Sefulu ituaiga o Mycobacterium tuberculosis ma sili atu190ituaiga o NTM na maua.
Laulau 1: Fa'amatalaga o Fualaau Fa'asaina 18+6 +190+NTM
Le lelei o le oloa
Malosi le fetu'una'i i togafitiga faafoma'i: e mafai ona iloa sa'o fa'ata'ita'iga o le sputum i se vaila'au e fa'asusu lava e aunoa ma se su'esu'ega.
E faigofie le fa'atinoga fa'ata'ita'i: e faigofie le ta'amilosaga muamua o le fa'agaioiga o le fa'ateleina, ma e mae'a le fausiaina o le faletusi i le 3 itula, lea e fa'aleleia atili ai le lelei o le galuega.
Fa'amaumauga atoatoa o le taina ma le tete'e atu i vaila'au: e aofia ai nofoaga e tete'e atu ai le taina ma vaila'au i le MTB ma le NTM, o vaega autū ia o popolega fa'aklinikal, sa'o le iloa o le taina ma le tete'e atu i vaila'au, lagolagoina o polokalama faakomepiuta tuto'atasi mo au'ili'iliga, ma le faia o lipoti au'ili'iliga i le kiliki e tasi.
Fegalegaleai: fetaui lelei o oloa, fetu'una'i i fa'avae autū a le ILM ma le MGI/ONT.
Fa'amatalaga o oloa
| Fa'ailoga oloa | igoa o le oloa | Fa'avae o le iloa | fa'amatalaga auiliili |
| HWTS-NGS-T001 | Meafaigaluega e iloa ai le tete'e atu i vaila'au ma le fa'avasegaina o Mycobacterium (metotia fa'ateleina tele) | ONT, Illumina, MGI, Salus pro | 16/96rxn |
Taimi na lafoina ai: Ianuari-23-2024