Su'i le eleele TB ma DR-TB Su'esu'ega Fofo e le #Macro & Micro -Su'ega!

Ose Auupega Fou mo le Su'esu'eina o le Tuberculosis ma le Su'esu'eina o Fualaau Fa'asaina: Ose Tupulaga Fou Fa'atulagaina Fa'asologa (tNGS) Tu'ufa'atasia ma le A'oa'oina o le Masini mo le Su'esu'ega o le Tuberculosis Hypersensitivity.

Lipoti o tusitusiga: CCa: o se fa'ata'ita'iga fa'ata'ita'iga e fa'avae i luga o le tNGS ma le a'oa'oina o masini, lea e talafeagai mo tagata e itiiti le fa'ama'i fa'ama'i ma le maningitis mamapala.

Ulutala su'esu'e: Tuberculous-targeted sequencing next generation ma masini a'oa'oina: o se fa'ata'ita'iga fa'ata'ita'iga e sili ona maaleale mo paucific pulmonary tubulas ma tubular meningitis.

Vaitaimi: 《Clinica Chimica Acta》

AFAI: 6.5

Aso fa'asalalau: Ianuari 2024

Faʻatasi ma le Iunivesite o Saina Academy of Sciences ma le Beijing Chest Hospital o le Capital Medical University, Macro & Micro-Test na faʻavaeina se faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga o le mamapala e faʻavae i luga o le tupulaga fou o le faʻatulagaina o faʻasologa (tNGS) tekinolosi ma le masini aʻoaʻoga, lea na maua ai le maualuga maualuga. ma'ale'ale su'esu'ega mo le mamapala ma nai siama ma mama mama mama, na maua ai se metotia fou o le su'esu'eina o le hypersensitivity mo le su'esu'eina o le falema'i o ituaiga e lua o le mamapala, ma fesoasoani i le su'esu'ega sa'o, su'esu'ega o fualaau fa'asaina ma togafitiga o le mamapala.I le taimi lava e tasi, e maua ai le plasma cfDNA o le tagata maʻi e mafai ona faʻaaogaina e avea o se ituaiga faʻataʻitaʻiga talafeagai mo faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻi ile suʻesuʻega ole TBM.

I lenei suʻesuʻega, e 227 faʻataʻitaʻiga o le plasma ma sua sua o le cerebrospinal na faʻaaogaina e faʻavae ai ni faʻataʻitaʻiga faʻapitoa e lua, lea na faʻaaogaina ai faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻi suʻesuʻe e faʻavae ai le faʻataʻitaʻiga aʻoaʻoga masini o suʻesuʻega mamapala, ma sa faʻaaogaina faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻi e faʻamaonia ai le faʻamautuina. fa'ata'ita'iga fa'apitoa.O fa'ata'ita'iga uma na mua'i fa'atatauina e se vaita'ele su'esu'e fa'apitoa mo le Mycobacterium tuberculosis.Ona, faʻavae i luga o faʻamaumauga faʻasologa o le TB-tNGS, o le faʻataʻitaʻiga o le laʻau faʻataʻitaʻiga e faʻaaogaina e faʻatino ai le 5-fold cross-validation i luga o aʻoaʻoga ma seti faʻamaonia o le faʻasologa o suʻesuʻega suʻesuʻe falesuesue, ma maua ai le faʻataʻitaʻiga o faʻataʻitaʻiga o faʻataʻitaʻiga plasma ma faʻataʻitaʻiga o le sua o le cerebrospinal.O le fa'ailoga ua maua e aumai i totonu o seti su'ega se lua o fa'asologa o su'esu'ega a le falema'i mo le su'eina, ma o le fa'atinoga o su'esu'ega a le tagata a'oa'o e su'esu'eina e le ROC curve.Mulimuli ane, na maua le fa'ata'ita'iga o su'esu'ega o le mamapala.

Ata 1 ata fa'ata'atia o le su'esu'ega

Iʻuga: E tusa ai ma faʻamaufaʻailoga faʻapitoa o le CSF DNA sample (AUC = 0.974) ma le plasma cfDNA sample (AUC = 0.908) fuafuaina i lenei suʻesuʻega, i totonu o faʻataʻitaʻiga 227, o le maʻaleʻale o le faʻataʻitaʻiga CSF o le 97.01%, o le faʻapitoa o le 95.65%, ma o le maaleale ma le faʻapitoa o faʻataʻitaʻiga plasma o 82.61% ma 86.36%.I le auʻiliʻiliga o 44 faʻataʻitaʻiga o le plasma cfDNA ma le cerebrospinal fluid DNA mai tagata maʻi TBM, o le faʻataʻitaʻiga o lenei suʻesuʻega e maualuga le tutusa o le 90.91% (40/44) i le plasma cfDNA ma le cerebrospinal fluid DNA, ma o le maaleale o le 95.45% (42/44).I tamaiti e maua i le mama mama, o le fuafuaga faʻataʻitaʻiga o lenei suʻesuʻega e sili atu ona maaleale i faʻataʻitaʻiga o le plasma nai lo le suʻesuʻega Xpert faʻataʻitaʻiga o faʻataʻitaʻiga sua o le gastric mai maʻi tutusa (28.57% VS 15.38%).

Ata 2 Su'esu'ega fa'atinoga o fa'ata'ita'iga su'esu'ega o le mamapala mo fa'ata'ita'iga o tagata

Ata 3 I'uga su'esu'e o fa'ata'ita'iga fa'atasi

Fa'ai'uga: O se fa'ata'ita'iga fa'apitoa fa'apitoa mo le mamapala na fa'atuina i lenei su'esu'ega, lea e mafai ona tu'uina atu ai se meafaigaluega fa'apitoa e maua ai le maualuga o le fa'alogoina o le ma'ale'ale mo tagata gasegase e maua i le oligobacillary tuberculosis (aganu'u leaga).O le su'esu'eina o le mamapala e fa'atatau i le plasma cfDNA atonu o se ituaiga fa'ata'ita'iga talafeagai mo le su'esu'eina o le mama'i ma'i mama'i (fa'ata'ita'iga o le plasma e faigofie ona aoina nai lo le sua o le cerebrospinal mo ma'i e masalomia le mamapala o le fai'ai).

Uluai so'oga: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/s0009898123004990?e ala i%3Dihub

Fa'atomuaga pu'upu'u o oloa su'esu'e fa'asologa o le fa'asologa o le fa'ama'i ma le fa'ata'oto

I le va'aiga i le lavelave o fa'ata'ita'iga tulaga o tagata mama'i mama'i ma mana'oga eseese, Macro & Micro-Test e tu'uina atu ai se seti atoatoa o vaifofo NGS mo le su'eina o le liquefaction mai fa'ata'ita'iga sputum, fau faletusi Qualcomm ma fa'asologa, ma su'esu'ega fa'amaumauga.O oloa e aofia ai suʻesuʻega vave o tagata mamaʻi mamaʻi, suʻesuʻeina o fualaau faʻasaina o le mamapala, faʻapipiʻiina o le mycobacterium tuberculosis ma le NTM, suʻesuʻega o le hypersensitivity o siama-negative tuberculosis ma tagata mamaʻi, ma isi.

Pusa su'esu'e fa'asologa mo le mamapala ma le mycobacteria:

Mea Nu igoa ole oloa mea e su'e ai oloa ituaiga faataitai fa'ata'ita'iga talafeagai
HWTS-3012 Fa'ata'ita'iga fa'asa'oloto sui Faʻaaogaina i le togafitiga liquefaction o sputum samples, ua maua se numera muamua-vasega faamaumauga, Sutong Machinery Equipment 20230047. fuga
HWTS-NGS-P00021 Qualcomm quantity detection kit for hypersensitive tuberculosis (su'esu'e auala e pu'e ai) Su'esu'eina le hypersensitivity e le fa'aoso (suavai biopsy) mo siama mama mama mama ma le fai'ai nodules;O faʻataʻitaʻiga o tagata ua masalomia na aʻafia i le mamapala poʻo le mycobacteria e le o le tuberculosis sa suʻesuʻeina e ala i le maualuga o le loloto o le faʻasologa o metagenomics, ma faʻamatalaga faʻamatalaga pe o le mamapala poʻo le le tuberculosis mycobacteria na aʻafia ma o le laina muamua o faʻamatalaga e tetee atu ai fualaau o le mycobacterium tuberculosis sa saunia. O le toto pito i luga, sua o le alveolar lavage, hydrothorax ma ascites, faʻataʻitaʻiga tuʻituʻi taulaʻi, sua o le cerebrospinal. Tupulaga lona lua
HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing and drug resistance detecting kit (multiplex amplification sequencing sequencing method) Mycobacterium typing test, e aofia ai le MTBC ma le 187 NTMOle su'esu'eina ole Mycobacterium tuberculosis ole su'esu'ega ole vaila'au e aofia ai vaila'au e 13 ma nofoaga autu e 16 o suiga ole kenera e tetee atu i fualaau. Sputum, alveolar lavage vai, hydrothorax ma ascites, fa'ata'ita'iga tu'i toto'a, sua o le cerebrospinal. Lua/tolu augatupulaga lua fa'avae

Fa'ailoga: HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing and drug resistance detection kit (multiplex amplification method)

Folasaga o oloa

O le oloa e faʻavae i luga o vailaʻau autu muamua ma le lua-laina o loʻo faʻamatalaina i taʻiala mo togafitiga o le TB WHO, macrolides ma aminoglycosides e masani ona faʻaaogaina i taʻiala o togafitiga NTM, ma o nofoaga e teteʻe ai vailaʻau e aofia uma ai vaega e tasi o nofoaga e faʻatatau i vailaʻau i le WHO Mycobacterium tuberculosis lavelave mutation catalog, faʻapea foʻi ma isi vailaʻau faʻasalaina genes ma suiga nofoaga e tusa ai ma suʻesuʻega ma faʻamaumauga o tusi maualuga togi i le fale ma fafo.

O le fa'ailogaina o le taina e fa'avae i luga ole NTM fa'ata'otoga i ta'iala a le NTM na lomia e le Chinese Journal of Tuberculosis and Respiratory Diseases ma le maliega a tagata popoto.E mafai ona fa'asili, fa'asologa ma fa'amaufa'ailoga le sili atu i le 190 ituaiga o NTM e fa'asologa o le ta'i tusi.

E ala i tekonolosi fa'alautele PCR ua fa'atatauina, o genes genotyping ma genes-resistant a Mycobacterium na fa'ateleina e le multiplex PCR, ma maua ai le fa'aputuga fa'aopoopo o kenera taula'i e iloa.O oloa faʻateleina e mafai ona fausia i totonu o le lua-tupulaga poʻo le tolu-tupulaga maualuga-throughput sequencing faletusi, ma o augatupulaga lona lua ma le tolu-tupulaga faʻasologa faʻasologa e mafai ona tuʻuina atu i le faʻasologa maualuga o le loloto e maua ai faʻamatalaga faʻasologa o kenera taulaʻi.I le fa'atusatusaina o suiga ua iloa o lo'o iai i totonu o fa'amaumauga fa'amaumauga (e aofia ai le WHO Mycobacterium tuberculosis complex mutation catalog ma lona sootaga ma le tete'e atu i vaila'au), o suiga e feso'ota'i ma le tete'e atu i vaila'au po'o le fa'aogaina o vaila'au fa'ama'i mama'i na fuafuaina.Faʻatasi ma le fofo o togafitiga faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga o le Macro & Micro-Test, o le faʻafitauli o le maualalo o le nucleic acid amplification lelei o faʻataʻitaʻiga sputum falemaʻi (fa sefulu taimi sili atu nai lo metotia masani) na foia, ina ia mafai ai ona faʻamaonia le suʻesuʻeina o fualaau faasaina. fa'aoga sa'o i fa'ata'ita'iga sputum falema'i.

Fa'asologa o mea e maua

34genes e feso'ota'i atu i fualaau fa'asaina o18fualaau fa'ama'i mamapala ma6Na maua fualaau NTM, ufiufi297nofoaga e tetee atu ai fualaau faasaina;Sefulu ituaiga o Mycobacterium tuberculosis ma sili atu190ituaiga NTM na maua.

Laulau 1: Fa'amatalaga o 18+6 Vailaau Fa'asaina +190+NTM

Lelei oloa

Malosi le fetuutuuna'i falema'i: o le sputum samples e mafai ona iloa sa'o i le tagata lava-liquefaction sui e aunoa ma aganuu.

O le faʻataʻitaʻiga faʻataʻitaʻiga e faigofie: o le taamilosaga muamua o le faʻalauteleina o galuega e faigofie, ma o le faletusi e maeʻa i le 3 itula, lea e faʻaleleia ai le lelei o galuega.

A'oa'oga lolomi ma le tetee atu i fualaau fa'asaina: fa'apipi'i le ta'itusi ma nofoaga e tete'e ai vaila'au o le MTB ma le NTM, o itu taua ia o popolega ile falema'i, sa'o le taina ma le su'esu'eina o vaila'au fa'asaina, lagolago i polokalame su'esu'e tuto'atasi, ma le fa'atupuina o lipoti au'ili'ili ile kiliki tasi.

Feso'ota'iga: fa'asoaga oloa, fetu'una'i i fa'auluuluga ILM ma MGI/ONT.

Fa'amatalaga o oloa

Fa'ailoga oloa igoa ole oloa Tulaga su'esu'e fa'amatalaga
HWTS-NGS-T001 Mycobacterium typing and drug resistance detection kit (multiplex amplification method) ONT, Illumina, MGI, Salus pro 16/96rxn

Taimi meli: Ian-23-2024